destiny: diffusion maps for large-scale single-cell data in R

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

destiny: diffusion maps for large-scale single-cell data in R

UNLABELLED : Diffusion maps are a spectral method for non-linear dimension reduction and have recently been adapted for the visualization of single-cell expression data. Here we present destiny, an efficient R implementation of the diffusion map algorithm. Our package includes a single-cell specific noise model allowing for missing and censored values. In contrast to previous implementations, w...

متن کامل

metrics for the detection of changed buildings in 3d old vector maps using als data (case study: isfahan city)

هدف از این تحقیق، ارزیابی و بهبود متریک های موجود جهت تایید صحت نقشه های قدیمی سه بعدی برداری با استفاده از ابر نقطه حاصل از لیزر اسکن جدید شهر اصفهان می باشد . بنابراین ابر نقطه حاصل از لیزر اسکنر با چگالی حدودا سه نقطه در هر متر مربع جهت شناسایی عوارض تغییر کرده در نقشه های قدیمی سه بعدی استفاده شده است. تمرکز ما در این تحقیق بر روی ساختمان به عنوان یکی از اصلی ترین عارضه های شهری می باشد. من...

Diffusion maps for changing data

Graph Laplacians and related nonlinear mappings into low dimensional spaces have been shown to be powerful tools for organizing high dimensional data. Here we consider a data set X in which the graph associated with it changes depending on some set of parameters. We analyze this type of data in terms of the diffusion distance and the corresponding diffusion map. As the data changes over the par...

متن کامل

Diffusion maps for high-dimensional single-cell analysis of differentiation data

MOTIVATION Single-cell technologies have recently gained popularity in cellular differentiation studies regarding their ability to resolve potential heterogeneities in cell populations. Analyzing such high-dimensional single-cell data has its own statistical and computational challenges. Popular multivariate approaches are based on data normalization, followed by dimension reduction and cluster...

متن کامل

An Efficient Data Replication Strategy in Large-Scale Data Grid Environments Based on Availability and Popularity

The data grid technology, which uses the scale of the Internet to solve storage limitation for the huge amount of data, has become one of the hot research topics. Recently, data replication strategies have been widely employed in distributed environment to copy frequently accessed data in suitable sites. The primary purposes are shortening distance of file transmission and achieving files from ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2015

ISSN: 1367-4803,1460-2059

DOI: 10.1093/bioinformatics/btv715